双方签订的合同如果双方内容不同法院的处理：
1、两份合同出现内容不一致的，则需要对合同不一致的条款或内容进行解释，从而判定哪份合同条款或内容才是双方的真实意思表示；
2、当双方就合同解释无法协商一致时，起诉至法院的，由法官综合案件情况以及相关的证据材料进行认定。
合同审批内容：
1、数量。对数量的描述应准确，计量单位、计量方法等应符合相关国家规定；
2、质量。如需适用国标、行标，合同中应明确标准代号之全称。合同中应设置“验收条款”，明确质量检验的方法、责任期限及质量异议期等；
3、价格或报酬。应明确数额、计算标准、结算方式和程序；
4、履约期限、地点和方式。履约地点、交付标的物的方式、劳务提供方式与结算方式均应具体明确；
5、违约责任。合同应明确规定违约责任，确定违约金的数额及计算方法；
6、争议解决。明确争议解决方式。
合同审批手续：
1、合同承办人将相关合同草案、事项在合同审批表中填写齐备后，办理报批手续；
2、承办部门负责人审核相关业务需求，签署审批意见；
3、法务对合同条款、内容的合法性、严密性、可行性进行审查；
4、管理层对相关合同进行审核，并签署相关意见；
5、公司印鉴管控人员予以签章。
综上所述，双方签订的合同如果双方内容不同法院的处理，两份合同出现内容不一致的，则需要对合同不一致的条款或内容进行解释，从而判定哪份合同条款或内容才是双方的真实意思表示；当双方就合同解释无法协商一致时，起诉至法院的，由法官综合案件情况以及相关的证据材料进行认定。
【法律依据】：
《中华人民共和国民法典》第四百六十六条
当事人对合同条款的理解有争议的，应当依据本法第一百四十二条第一款的规定，确定争议条款的含义。
合同文本采用两种以上文字订立并约定具有同等效力的，对各文本使用的词句推定具有相同含义。各文本使用的词句不一致的，应当根据合同的相关条款、性质、目的以及诚信原则等予以解释。
第四百六十七条
本法或者其他法律没有明文规定的合同，适用本编通则的规定，并可以参照适用本编或者其他法律最相类似合同的规定。
在中华人民共和国境内履行的中外合资经营企业合同、中外合作经营企业合同、中外合作勘探开发自然资源合同，适用中华人民共和国法律。
